.cram Filudvidelse
FiltypeCompressed Alignment File
| Udvikler | EBI |
| Kategori | Data Files |
| Format | Binary |
.CRAM option nummer
Komprimeret alignment-filformat udviklet af EBI, en udstation under European Molecular Biology Laboratory; gemmer korte DNA-sekvenslæsningstilpasninger genereret af short read aligners såsom BWA, BBMap og BLAT.
CRAM-filformatet ligner BAM-filformatet (Binary Alignment/Map), men har en bedre filkomprimering og et omstruktureret kolonneorienteret binært containerformat. I takt med at datamængderne stiger inden for genetisk software, blev CRAM-formatet udviklet for at reducere diskfodaftrykket af justeringsdata.
Kortlæsningsjustering er processen med at afkode, hvor en sekvens kommer fra i genomet. Dette kan være vanskeligt, da referencegenomet er ret stort, og man ikke altid leder efter nøjagtige match i referencegenomet. Short read aligners bruges til at søge i enorme sekvenser efter match og næsten-match. Da sekvenserne er så store, er det nødvendigt med komprimering i formater som CRAM for at holde filstørrelsen overskuelig.
| Windows |
|